IATF16949認證機構應制定一個內部審計過程，以有效地實施所需的關鍵過程和操作程序。
內部系統審計過程應包括對所有參與IATF16949的辦公室進行的IATF16949認證活動的專門內部系統審計，以證明其符合本規則的要求。
內部系統審計方案應按年度計劃。

IATF16949認證機構的內部審核應在簽約辦公室和所有參與IATF16949認證活動的區域辦公室每12(12)個月至少進行一次。如果認證機構能夠證明按照本規則持續有效地實施管理體系，可以減少區域辦公室內部審計的頻率。
IATF16949認證機構簽約辦公室應當管理內部審核計劃，以確保：
a)內部審核由合格人員進行(見第4.6條):
b)每次審核都編制j有審核計劃:
c)內部審程方法進行內部審核:
d)選擇的審核員可以保證公正客觀:
e)為所有IATF16949相關流程和程序以及適當數量的客戶文件(包括第一階段和第二階段的認證審核、監督、再認證、特殊審核、轉移審核)抽樣，以及IATF數據庫評審計劃提供了足夠的時間：
。在每個辦公室的每個內部系統審核過程中，IATF16949認證活動的審核時間不少于1(1)天。
g)負責審核過程的個人可以知道審核結果:

HIATF16949認證機構內部系統審核報告至少應包括：
-審核的關鍵過程和程序列表:
-抽樣客戶名稱和審核類型:
-確定的不符合項。

(一)任何內部審核的行動部門應及時、適當地進行：
j)所有參與IATF16949相關活動的辦公室內部審核結果報告給簽約辦公室，包括在管理審核過程中。
IATF保留觀察IATF16949認證機構內部體系審核、跟蹤糾正措施、基于績效進行額外活動的權利。